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La inteligencia artificial (IA) se consolida como una herramienta clave en la investigación biomédica. Un reciente desarrollo del Centro de Investigación Cooperativa en Biomateriales CIC biomaGUNE, en San Sebastián, en colaboración con Multiverse Computing, ha dado como resultado una plataforma capaz de identificar secuencias proteicas relevantes para el sistema inmunitario.

epiGPTope: Aprendizaje Automático al Servicio de la Inmunología

La plataforma, denominada epiGPTope, utiliza el aprendizaje automático para generar, clasificar y seleccionar epítopos. Los epítopos son fragmentos de proteínas que el sistema inmunitario reconoce al detectar virus o bacterias, desencadenando la respuesta inmunitaria y la producción de anticuerpos. La identificación de nuevos epítopos es fundamental para el desarrollo de diagnósticos, inmunoterapias y vacunas más efectivas.

Creación de una Librería de Epítopos Sintéticos

El laboratorio de Nanotecnología Biomolecular de CIC biomaGUNE, dirigido por la profesora Aitziber L.

Cortajarena, está utilizando esta tecnología para crear una extensa librería de cientos de miles de epítopos sintéticos.

Aitor Manteca, investigador del proyecto, explica que el sistema permite analizar millones de combinaciones y seleccionar aquellos epítopos sintéticos que imitan a los naturales, facilitando su reconocimiento por los anticuerpos. Este método agiliza y optimiza la selección de secuencias relevantes, reduciendo costos y mejorando la precisión.

Aplicaciones en Biomedicina y Biotecnología

La herramienta también clasifica los epítopos según su origen viral o bacteriano, ampliando sus aplicaciones en biomedicina y biotecnología. Esto permite a los investigadores construir una librería optimizada de miles de unidades, facilitando la experimentación en el laboratorio.

El objetivo principal es probar aplicaciones concretas. Los investigadores pueden evaluar un epítopo específico frente a un anticuerpo de forma rápida y económica, obteniendo resultados significativos en un tiempo reducido.

Potencial para Diagnósticos Avanzados

Este avance abre la posibilidad de estudiar millones de combinaciones en un corto período y predecir qué secuencias podrían activar respuestas inmunitarias.

Sus aplicaciones abarcan nuevas técnicas de diagnóstico y dispositivos para detectar la presencia de bacterias o virus en muestras biológicas, como sangre, o en entornos como el agua.

Proyección Industrial

CIC biomaGUNE destaca el potencial industrial de estos desarrollos. La rápida generación y selección de epítopos podría impulsar soluciones diagnósticas más avanzadas y extender el alcance de estas tecnologías a campos biomédicos, ambientales y biotecnológicos, fortaleciendo la conexión entre la investigación básica y su aplicación práctica.